MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 47023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009481	CGTCC	2	10	238	247	0 %	20 %	20 %	60 %	148238337
2	NC_009481	TGC	2	6	271	276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238337
3	NC_009481	CCG	2	6	280	285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238337
4	NC_009481	CTGC	2	8	348	355	0 %	25 %	25 %	50 %	148238337
5	NC_009481	TC	3	6	419	424	0 %	50 %	0 %	50 %	148238337
6	NC_009481	ACC	2	6	447	452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238337
7	NC_009481	GCG	2	6	460	465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238337
8	NC_009481	GAC	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238337
9	NC_009481	TGG	2	6	544	549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238337
10	NC_009481	GCT	2	6	579	584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238337
11	NC_009481	GCA	2	6	601	606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238337
12	NC_009481	TGA	2	6	626	631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238337
13	NC_009481	GAT	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238337
14	NC_009481	GAG	2	6	759	764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238337
15	NC_009481	CCCT	2	8	802	809	0 %	25 %	0 %	75 %	148238337
16	NC_009481	TGGC	2	8	841	848	0 %	25 %	50 %	25 %	148238337
17	NC_009481	CTT	2	6	875	880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238337
18	NC_009481	GGT	3	9	893	901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238337
19	NC_009481	GCC	2	6	906	911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238337
20	NC_009481	CT	3	6	1022	1027	0 %	50 %	0 %	50 %	148238337
21	NC_009481	CAA	2	6	1058	1063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238337
22	NC_009481	TGT	2	6	1064	1069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238337
23	NC_009481	ATC	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238337
24	NC_009481	TC	3	6	1146	1151	0 %	50 %	0 %	50 %	148238337
25	NC_009481	GAG	2	6	1170	1175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238337
26	NC_009481	ACC	2	6	1263	1268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238337
27	NC_009481	TC	3	6	1277	1282	0 %	50 %	0 %	50 %	148238337
28	NC_009481	CGG	2	6	1285	1290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238337
29	NC_009481	ATG	2	6	1291	1296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238337
30	NC_009481	TCT	2	6	1367	1372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238338
31	NC_009481	TCC	2	6	1448	1453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238338
32	NC_009481	CTG	2	6	1464	1469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238338
33	NC_009481	CAAC	2	8	1499	1506	50 %	0 %	0 %	50 %	148238338
34	NC_009481	GAT	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238338
35	NC_009481	CAG	2	6	1548	1553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238338
36	NC_009481	CGG	2	6	1573	1578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238338
37	NC_009481	GACC	2	8	1580	1587	25 %	0 %	25 %	50 %	148238338
38	NC_009481	GCGA	2	8	1645	1652	25 %	0 %	50 %	25 %	148238338
39	NC_009481	CTA	2	6	1703	1708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238338
40	NC_009481	AGC	2	6	1743	1748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238338
41	NC_009481	TCG	2	6	1774	1779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238338
42	NC_009481	TGA	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238338
43	NC_009481	CGTC	2	8	1847	1854	0 %	25 %	25 %	50 %	148238338
44	NC_009481	AGC	2	6	1888	1893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238338
45	NC_009481	CAG	2	6	1896	1901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238338
46	NC_009481	GGA	2	6	1940	1945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238338
47	NC_009481	GGA	2	6	1955	1960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238338
48	NC_009481	G	6	6	1969	1974	0 %	0 %	100 %	0 %	148238338
49	NC_009481	C	6	6	1990	1995	0 %	0 %	0 %	100 %	148238338
50	NC_009481	GATC	2	8	2055	2062	25 %	25 %	25 %	25 %	148238338
51	NC_009481	ACG	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238338
52	NC_009481	AGG	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238339
53	NC_009481	GCC	2	6	2245	2250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238339
54	NC_009481	TGC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
55	NC_009481	TGG	2	6	2371	2376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
56	NC_009481	GTG	2	6	2397	2402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
57	NC_009481	CGG	2	6	2458	2463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238339
58	NC_009481	GCC	2	6	2481	2486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238339
59	NC_009481	GGGA	2	8	2495	2502	25 %	0 %	75 %	0 %	148238339
60	NC_009481	TCC	2	6	2503	2508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238339
61	NC_009481	CTG	2	6	2544	2549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
62	NC_009481	TGA	2	6	2573	2578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238339
63	NC_009481	G	8	8	2657	2664	0 %	0 %	100 %	0 %	148238339
64	NC_009481	GTG	2	6	2778	2783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
65	NC_009481	GCA	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238339
66	NC_009481	CGGGA	2	10	2805	2814	20 %	0 %	60 %	20 %	148238339
67	NC_009481	GAT	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238339
68	NC_009481	GATT	2	8	2908	2915	25 %	50 %	25 %	0 %	148238339
69	NC_009481	TGG	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
70	NC_009481	GCT	2	6	2992	2997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
71	NC_009481	GGC	2	6	3005	3010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238339
72	NC_009481	CTG	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
73	NC_009481	GTG	2	6	3120	3125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
74	NC_009481	GAG	2	6	3138	3143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238339
75	NC_009481	CCG	2	6	3161	3166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238339
76	NC_009481	GCAG	2	8	3176	3183	25 %	0 %	50 %	25 %	148238339
77	NC_009481	TGT	2	6	3185	3190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238339
78	NC_009481	GAA	2	6	3204	3209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238339
79	NC_009481	TGC	2	6	3223	3228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
80	NC_009481	GCT	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
81	NC_009481	ATCA	2	8	3285	3292	50 %	25 %	0 %	25 %	148238339
82	NC_009481	G	6	6	3385	3390	0 %	0 %	100 %	0 %	148238339
83	NC_009481	CTG	2	6	3396	3401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
84	NC_009481	CTG	2	6	3405	3410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
85	NC_009481	GAT	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238339
86	NC_009481	CCA	2	6	3418	3423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238339
87	NC_009481	CAG	2	6	3459	3464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238339
88	NC_009481	GGT	2	6	3479	3484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
89	NC_009481	CGG	2	6	3491	3496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238339
90	NC_009481	TGC	2	6	3503	3508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
91	NC_009481	G	6	6	3550	3555	0 %	0 %	100 %	0 %	148238339
92	NC_009481	GGC	2	6	3569	3574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238339
93	NC_009481	G	6	6	3619	3624	0 %	0 %	100 %	0 %	148238339
94	NC_009481	GAC	2	6	3837	3842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238339
95	NC_009481	TGG	2	6	3874	3879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
96	NC_009481	TGG	2	6	3883	3888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
97	NC_009481	GGGT	2	8	3910	3917	0 %	25 %	75 %	0 %	148238339
98	NC_009481	GGCCT	2	10	3918	3927	0 %	20 %	40 %	40 %	148238339
99	NC_009481	CTT	2	6	3954	3959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238339
100	NC_009481	CGA	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238339
101	NC_009481	GAT	2	6	3984	3989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238339
102	NC_009481	GGTT	2	8	3992	3999	0 %	50 %	50 %	0 %	148238339
103	NC_009481	GCA	2	6	4006	4011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238339
104	NC_009481	CTG	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
105	NC_009481	AGC	2	6	4075	4080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238339
106	NC_009481	CTG	2	6	4119	4124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
107	NC_009481	CAG	2	6	4139	4144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238339
108	NC_009481	G	6	6	4256	4261	0 %	0 %	100 %	0 %	148238339
109	NC_009481	TTG	2	6	4270	4275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238339
110	NC_009481	GCGG	2	8	4283	4290	0 %	0 %	75 %	25 %	148238339
111	NC_009481	TGA	2	6	4322	4327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238339
112	NC_009481	GGA	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238340
113	NC_009481	GCG	2	6	4569	4574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238340
114	NC_009481	GCA	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238340
115	NC_009481	GTCA	2	8	4718	4725	25 %	25 %	25 %	25 %	148238340
116	NC_009481	GCTC	2	8	4744	4751	0 %	25 %	25 %	50 %	148238340
117	NC_009481	GCA	3	9	4800	4808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238340
118	NC_009481	CCAG	2	8	4822	4829	25 %	0 %	25 %	50 %	148238340
119	NC_009481	TGA	2	6	4836	4841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238340
120	NC_009481	TGA	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238340
121	NC_009481	CCA	2	6	4938	4943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238340
122	NC_009481	CAG	2	6	4973	4978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238340
123	NC_009481	CGG	2	6	5019	5024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238340
124	NC_009481	TC	3	6	5123	5128	0 %	50 %	0 %	50 %	148238340
125	NC_009481	GAG	2	6	5132	5137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238340
126	NC_009481	CAG	2	6	5158	5163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238340
127	NC_009481	CAT	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238340
128	NC_009481	GCC	2	6	5192	5197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238340
129	NC_009481	TGA	2	6	5203	5208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238340
130	NC_009481	ACCCC	2	10	5247	5256	20 %	0 %	0 %	80 %	148238340
131	NC_009481	CAC	2	6	5281	5286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238340
132	NC_009481	GAT	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238340
133	NC_009481	CGG	2	6	5397	5402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238340
134	NC_009481	GTCG	2	8	5513	5520	0 %	25 %	50 %	25 %	148238340
135	NC_009481	TTCA	2	8	5525	5532	25 %	50 %	0 %	25 %	148238340
136	NC_009481	CCCA	2	8	5534	5541	25 %	0 %	0 %	75 %	148238340
137	NC_009481	GAT	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238340
138	NC_009481	CAC	2	6	5712	5717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238340
139	NC_009481	CGATAC	2	12	5746	5757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148238340
140	NC_009481	GGA	2	6	5791	5796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238340
141	NC_009481	AAGG	2	8	5840	5847	50 %	0 %	50 %	0 %	148238340
142	NC_009481	TGG	2	6	5850	5855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238340
143	NC_009481	GGC	2	6	5857	5862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238340
144	NC_009481	GATG	2	8	5920	5927	25 %	25 %	50 %	0 %	148238340
145	NC_009481	AGC	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238341
146	NC_009481	GAC	2	6	6094	6099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238341
147	NC_009481	TCC	2	6	6140	6145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238341
148	NC_009481	GGCA	2	8	6201	6208	25 %	0 %	50 %	25 %	148238341
149	NC_009481	TTC	2	6	6237	6242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238341
150	NC_009481	GGC	2	6	6246	6251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238341
151	NC_009481	CAG	3	9	6256	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238341
152	NC_009481	CTG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238341
153	NC_009481	CTC	2	6	6429	6434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238341
154	NC_009481	CCT	2	6	6435	6440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238341
155	NC_009481	CGG	2	6	6450	6455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238341
156	NC_009481	CCT	2	6	6471	6476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238341
157	NC_009481	CAC	2	6	6484	6489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238341
158	NC_009481	GCT	2	6	6553	6558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238341
159	NC_009481	CAG	2	6	6559	6564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238341
160	NC_009481	ACC	2	6	6629	6634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238341
161	NC_009481	TGC	2	6	6683	6688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238341
162	NC_009481	CAGC	2	8	6735	6742	25 %	0 %	25 %	50 %	148238341
163	NC_009481	GAT	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238341
164	NC_009481	TGA	2	6	6846	6851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238341
165	NC_009481	CGT	2	6	6864	6869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238341
166	NC_009481	GGGA	2	8	6892	6899	25 %	0 %	75 %	0 %	148238341
167	NC_009481	GGC	2	6	6915	6920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238341
168	NC_009481	AGG	2	6	6965	6970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238341
169	NC_009481	CCA	2	6	6984	6989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238341
170	NC_009481	GCG	2	6	6997	7002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238341
171	NC_009481	CTT	2	6	7018	7023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238341
172	NC_009481	CAG	2	6	7054	7059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238341
173	NC_009481	AGC	2	6	7079	7084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238341
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179	NC_009481	CTG	2	6	7417	7422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238341
180	NC_009481	ATG	2	6	7448	7453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238341
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182	NC_009481	GCC	2	6	7585	7590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238341
183	NC_009481	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238341
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185	NC_009481	AGGT	2	8	7760	7767	25 %	25 %	50 %	0 %	148238341
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212	NC_009481	TCGA	2	8	8722	8729	25 %	25 %	25 %	25 %	148238342
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218	NC_009481	TGG	3	9	8903	8911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238342
219	NC_009481	GTC	2	6	8943	8948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238342
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223	NC_009481	TCC	2	6	9241	9246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238342
224	NC_009481	CAG	2	6	9261	9266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238342
225	NC_009481	GCCGAT	2	12	9282	9293	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148238342
226	NC_009481	TTC	2	6	9309	9314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238342
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228	NC_009481	CAG	2	6	9606	9611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238343
229	NC_009481	TTGA	2	8	9660	9667	25 %	50 %	25 %	0 %	148238343
230	NC_009481	GCT	2	6	9730	9735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238343
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233	NC_009481	CAG	2	6	9900	9905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238343
234	NC_009481	CCAGC	3	15	9966	9980	20 %	0 %	20 %	60 %	148238343
235	NC_009481	GTT	2	6	10046	10051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238343
236	NC_009481	CAC	2	6	10092	10097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238343
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239	NC_009481	CAA	2	6	10209	10214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238343
240	NC_009481	CTG	2	6	10220	10225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238343
241	NC_009481	TGC	2	6	10239	10244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238343
242	NC_009481	GCGCAG	2	12	10302	10313	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148238343
243	NC_009481	AGGG	2	8	10326	10333	25 %	0 %	75 %	0 %	148238343
244	NC_009481	CTCGG	2	10	10359	10368	0 %	20 %	40 %	40 %	148238343
245	NC_009481	CCA	2	6	10474	10479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238344
246	NC_009481	CGC	2	6	10500	10505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238344
247	NC_009481	TGA	2	6	10585	10590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238344
248	NC_009481	CAG	2	6	10598	10603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238344
249	NC_009481	CTC	2	6	10604	10609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238344
250	NC_009481	TGCTCA	2	12	10656	10667	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148238344
251	NC_009481	TCGCG	2	10	10668	10677	0 %	20 %	40 %	40 %	148238344
252	NC_009481	CCG	2	6	10703	10708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238344
253	NC_009481	AGC	2	6	10896	10901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238344
254	NC_009481	GGC	2	6	10954	10959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238344
255	NC_009481	CAG	2	6	10997	11002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238344
256	NC_009481	CAG	2	6	11006	11011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238344
257	NC_009481	CGG	2	6	11053	11058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238344
258	NC_009481	GGT	2	6	11071	11076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238344
259	NC_009481	CTG	2	6	11096	11101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238344
260	NC_009481	GGTT	2	8	11133	11140	0 %	50 %	50 %	0 %	148238345
261	NC_009481	GTCCA	2	10	11175	11184	20 %	20 %	20 %	40 %	148238345
262	NC_009481	CCA	2	6	11275	11280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238345
263	NC_009481	CTGG	2	8	11285	11292	0 %	25 %	50 %	25 %	148238345
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276	NC_009481	CT	3	6	11996	12001	0 %	50 %	0 %	50 %	148238346
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382	NC_009481	GGA	2	6	16912	16917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238349
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500	NC_009481	TG	3	6	21623	21628	0 %	50 %	50 %	0 %	148238354

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